Mac ที่ติดตั้ง Thunderbolt สามารถบู๊ตจากไดรฟ์ Thunderbolt ภายนอกได้ ซึ่งหมายความว่าคุณสามารถเรียกใช้การติดตั้ง Mac OS X, Windows หรือ Linux เต็มรูปแบบจากไดรฟ์ภายนอกที่เชื่อมต่อกับ Mac ที่มีการเชื่อมต่อแบบ Thunderbolt และเนื่องจากความเร็วของ Thunderbolt จึงทำให้เร็วมาก เร็วแค่ไหน? ตามทฤษฎีแล้ว Mac OS X ที่ทำงานบนไดรฟ์ Thunderbolt ภายนอกควรจะเร็วพอๆ กับการบูทจากไดรฟ์ภายใน แต่การใช้ SSD ภายนอกจะเร็วกว่าฮาร์ดไดรฟ์แบบหมุนภายใน

สิ่งนี้ยังเปิดประตูสำหรับตัวเลือกการบูทคู่ของ OS X เพิ่มเติม การบูท OS หลายตัว และการขยายอย่างรวดเร็วเป็นพิเศษบนฮาร์ดแวร์ที่ถูกจำกัดด้วยตัวเลือกการขยายภายใน ปัจจุบัน Thunderbolt มาพร้อมกับ MacBook Pro และ iMac แต่คาดว่าจะได้รับแรงฉุดเพิ่มขึ้นด้วยการรวมเข้ากับการรีเฟรชฮาร์ดแวร์ของ MacBook Air, Mac Mini และ Mac Pro ที่กำลังจะมาถึง

ความสามารถในการบู๊ตได้รับการยืนยันโดย Anandtech ซึ่งยืนยันว่าไดรฟ์ Thunderbolt ภายนอกสามารถบู๊ตได้เมื่อทำการวิจัยการตั้งค่า RAID Pegasus ขนาด 12TB ซึ่งแสดงไว้ด้านบนซึ่งแนบมากับ MacBook Pro

พบสิ่งนี้ผ่าน MacRumors พวกเขายังกล่าวถึงว่า Thunderbolt รองรับ Target Disk Mode ซึ่งเป็นตัวเลือกที่จำกัดไว้สำหรับ Mac ที่ติดตั้ง Firewire เท่านั้น

Update: การสาธิตความเร็วของ Thunderbolt vs FireWire และ USB 2.0 คือแผนภูมิมาตรฐานล่าสุดจาก MacWorld ที่แสดงไดรฟ์ Thunderbolt ภายนอก ความเร็วที่เหลือเชื่อ:

ความเร็วในการอ่านและเขียนนั้นเร็วพอๆ กันหากไม่เร็วกว่า SSD ภายในหลายๆ รุ่น!